A No trechopara questões que desconhecia, o verbo deve ser pluralizado visto que se refere à palavra questões, que está no plural.
B O verbo permanecer,em doença aparecia numas cidades e não em outras, que permaneciam totalmente imunes à epidemia, por se ligar à palavra doença, deveria estar no singular.
C Alterando-se a fraseficavam receitando remédios absurdos, rezaspara ficavam receitando remédios e rezas absurdos, ela estaria ainda de acordo com as regras da escrita culta.
D Se a palavra informações, emNão há informações mais precisas nessa história, for trocada por informes não haverá necessidade de alterar o gênero da palavra precisas.
E EmGaleno [...] e tinha dúvidas sobre a disposição dos músculos do corpo humano, o termo dúvidas deveria estar no singular, concordando com Galeno.