A metodologia quantitativa, considerando-se os agentes epidemiologicamente mais importantes, de acordo com as notificações compulsórias da região.
B metodologia qualitativa, considerando-se os agentes epidemiologicamente mais frequentes, tendo em vista o perfil epidemiológico da região, do próprio serviço e dos trabalhadores do serviço de saúde.
C metodologia exploratória, fazendo-se o levantamento de todos os agentes etiológicos que causam adoecimento por doenças infecciosas no município e as regiões circunvizinhas.
D metodologia descritiva, fazendo-se o levantamento de todos os agentes infecciosos causadores de doenças infecciosas, tendo em vista o perfil epidemiológico da região, do próprio serviço e dos trabalhadores do serviço de saúde.