A Os dados da lista de picos do espectro obtido do microrganismo desconhecido são comparados com os dados das listas de picos dos espectros de referência contidos no banco de dados, e uma análise de ranqueamento de similaridade é realizada.
B Os dados da lista de picos são submetidos a um algoritmo de deconvolução para reconstrução da sequência peptídica dos componentes do espectro, permitindo a identificação direta por comparação com bancos de dados genômicos.
C Após a criação da lista de picos, o espectro é normalizado por espectrometria tandem (MS/MS), em que fragmentos secundários são gerados e comparados com espectros de fragmentação padronizados na biblioteca de espectros de referência.
D A lista de picos é convertida em um espectro bidimensional, no qual os sinais são reorganizados por tempo de retenção cromatográfica e força de absorção da matriz, antes da classificação taxonômica em bancos de dados genômicos.
E A intensidade dos picos monoisotópicos é comparada à intensidade dos picos monoisotópicos de espectros de referência presentes na biblioteca espectral de referência.