A a matriz de gel (ovais laranja) consiste em longas cadeias de oligômeros lineares.
B a dimensão das cadeias interligadas, ou poros, não depende da concentração de agarose ou de acrilamida utilizada no gel.
C os poros nos géis de agarose são menores do que nos géis de acrilamida.
D os géis de acrilamida são utilizados para separar fragmentos grandes de DNA (≈500 pb a ≈20 kb) e os de agarose para separar fragmentos pequenos de DNA (1 nucleotídeo a ≈2 kb).
E sob a ação da corrente elétrica que passa através do gel os fragmentos são separados, movendo-se para o polo positivo a uma taxa inversamente proporcional ao logaritmo da sua dimensão, formando bandas que são visualizadas por autorradiografia.