A A extração de DNA cromossômico é feita com a incorporação das células bacterianas a serem lisadas em blocos de agarose, que garante a carga positiva e proporciona a migração em direção ao polo negativo da cuba de eletroforese.
B É utilizada desde em estudos de surtos hospitalares de pequenas proporções, até na comparação de populações bacterianas, envolvendo micro-organismos de diferentes países.
C Durante a eletroforese em campo elétrico com ângulo de 120°, as moléculas de DNA de maior tamanho se posicionam em paralelo ao campo elétrico de forma mais rápida que as menores.
D Na maioria dos protocolos, utiliza-se a temperatura de 37°C na corrida do gel, uma vez que é a temperatura ótima que garante melhor resolução e maior rapidez na migração das moléculas.