A indisponibilidade da vacina VA-MENGOC-BC, cuja produção foi interrompida pelo governo cubano na década passada
B não imunogenicidade do polissacarídeo de cápsula dos meningococos grupo B, sendo as vacinas baseadas em proteínas de membrana de alto custo e com baixa evidência de imunidade de rebanho
C incidência muito baixa de meningites por meningococos do grupo B – contrária à elavada ocorrência dos demais grupos – torna questionáveis estratégicas públicas de vacinação
D baixa adesão da população às vacinas contra meningococos do grupo B devida à grande incidência de eventos adversos observada no hemisfério norte
E perda de eficácia da vacina conjugada ACWY quando a ela são incluídos antígenos capsulares do grupo B