A está modelada corretamente, já que permite visualizar em que projeto cada funcionário está trabalhando e quantos funcionários estão alocados em cada projeto.
B não está correta, pois seria necessário definir uma chave primária composta pelos campos idProjeto e MatriculaFuncionario, já que há repetição de idProjeto em várias linhas.
C deve ser desmembrada em duas tabelas relacionadas com cardinalidade 1:n (Projeto e Funcionario), para evitar a repetição dos dados do projeto para cada funcionário que participa dele.
D não está adequadamente modelada, pois um mesmo funcionário pode participar de vários projetos ao mesmo tempo, contrariando as regras do modelo relacional.
E deve ser ampliada, incluindo-se outras informações sobre o projeto (como valor e descrição) e sobre os funcionários (como cargo e função).