A A extração de RNA baseada em colunas de sílica é vantajosa especialmente quando têm-se pequenas quantidades de células ou tecidos, já que com este método é possível obter cerca de 90 vezes mais RNA do que os protocolos baseados em fenol-clorofórmio.
B Antes de realizar a extração de RNA, deve-se observar que o armazenamento adequado das amostras também é de extrema importância. Isto porque o RNA é propenso à degradação e, como diferentes RNAs podem ter estabilidade diferente, isso pode influenciar o padrão de expressão gênica.
C A obtenção de RNA de alta qualidade depende do método ou kit de extração de RNA utilizado.
D Independentemente da condição de armazenamento e do procedimento de extração de RNA utilizado, é necessário determinar não apenas a qualidade, mas também a quantidade de RNA antes das análises posteriores.
E Embora a extração de RNA convencional com fenol-clorofórmio seja preferível a colunas à base de sílica, especialmente quando o custo é uma preocupação ou maior rendimento de RNA é desejado, ela pode resultar em contaminação significativa de RNA.