A A PCR em duas etapas ou nested PCR consiste na utilização de dois pares de iniciadores na mesma reação para aumentar a sensibilidade da reação.
B A PCR inverso é utilizado para amplificar fragmentos de DNA linear através de PCR, no qual apenas a sequência de um fragmento interno desta sequência é conhecida.
C A PCR de fusão consiste na fusão de sequências de DNA conhecidas através de PCR, no qual alguns iniciadores devem ter homologia de bases entre si.
D A PCR tradicional consiste de dois iniciadores com sentidos opostos que se anelam na mesma fita simples de DNA, promovendo a amplificação do fragmento localizado entre eles.
E Na PCR multiplex, pares de iniciadores diferentes são utilizados para amplificação de alvos distintos, em amostras diferentes.