Os lisossomos desempenham um papel crucial na regulação da resposta imune celular através do processamento e apresentação de anticorpos. Após a fagocitose de partículas estranhas, como bactérias ou vírus, os lisossomos fundem-se com as mitocôndrias, formando os lisossomos secundários ou vacúolos digestivos. Dentro desses vacúolos, as enzimas lisossomais digestivas degradam os antígenos estranhos em peptídeos.
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