A apresenta-se sob três formas principais: inflamatória, fistulosa e fibroestenosante.
B os segmentos do tubo digestivo mais acometidos são íleo, cólon e região perianal.
C pode ter manifestações extraintestinais, sendo as mais frequentes as oftalmológicas, dermatológicas e reumatológicas.
D pacientes com doença leve a moderada usualmente têm Índice de Harvey-Bradshaw superior a 8.
E o sintoma mais comum no momento do diagnóstico é diarreia.