A como exonucleases, clivando nucleotídeos do DNA alvo nas extremidades livres.
B identificando determinadas sequências específicas e clivando as ligações entre o grupo hidroxila 3' de um nucleotídeo e o grupo fosfato 5' do nucleotídeo adjacente.
C como endonucleases, pela interação dos aminoácidos do sítio de ligação e as ligações de hidrogênio entre as bases nitrogenadas.
D adicionando novos nucleotídeos às sequências coesivas de quatro a sesis nucleotídeos, partir da extremidade 5' do grupamento fosfato.
E como ligases em experimentos de clonagem de DNA, para a inserção de sequências gênicas em plamídeos bacterianos.