Os quirópteros apresentam características que contribuem para um eficiente papel nas diversas zoonoses. Quarenta espécies de Emballonuridae, Molossidae, Mormoopidae, Noctilionidae, Phyllostomidae, Thyropteridae e Vespertilionidae estão envolvidas em zoonoses causadas por protozoários, principalmente a doença de Chagas e as leishmanioses. Nas zoonoses causadas por vírus, sendo a raiva a mais importante, 43 espécies de Phyllostomidae, Molossidae e Vespertilionidae foram reportadas. Nas zoonoses causadas por bactérias, 13 espécies de Phyllostomidae, Molossidae e Vespertilionidae estão envolvidas, sendo Rickettsia ricketsii, causadora da febre maculosa, encontrada em 10 espécies. Dez espécies de Phyllostomidae e Molossidae apresentaram registros de infecção por fungos, incluindo o Histoplasma capsulatum, causador da histoplasmose. Das nove famílias de Chiroptera encontradas no Brasil, sete apresentaram espécies envolvidas em zoonoses, com Phyllostomidae e Molossidae apresentando relação com várias zoonoses. Artibeus lituratus, Desmodus rotundus e Molossus molossus são as espécies com maior número de casos positivos para agentes etiológicos. Essas espécies apresentam ampla distribuição neotropical, sendo geralmente abundantes e comuns em áreas urbanas, fatores que, somados às características da biologia e ecologia dos quirópteros, contribuem significativamente no ciclo de importantes zoonoses (Corrêa et.al., 2013).
A raiva, causada pelos vírus do gênero Lyssavirus, é a doença mais conhecida transmitida pelos morcegos. Essa doença: