A a tecnologia ainda não permite que numerosos genes possam ser controlados de forma simultânea.
B as espécies envolvidas na transferência de genes precisam ser capazes de hibridizar-se entre si.
C genes exógenos obtidos pelo uso de plasmídeo podem ser transmitidos à descendência.
D genes de resistência a patógenos em uma espécie de planta são identificados, mas ainda não é possível transferi-los para as espécies susceptíveis à doença.