A a intermitência da fonte, por ser renovável, exige sistemas de armazenamento térmico e químico de grande escala.
B a baixa temperatura dos reservatórios geotérmicos brasileiros que inviabiliza a geração de eletricidade para esse tipo de fonte.
C a emissão de grandes volumes de gases de efeito estufa (GEE) durante a operação das usinas com a troca de calor dos fluidos de trabalho da usina geotérmica.
D a limitação de uso apenas para aquecimento direto, como no caso de cidades brasileiras Caldas Novas - GO e Caxambu - MG sem possibilidade de geração elétrica.
E os altos custos iniciais de perfuração e exploração profunda, e a necessidade de tecnologias específicas para a conversão do calor em eletricidade.