A nem todos os subtipos de HLA B27 estão relacionados à doença e alguns conferem proteção.
B a progressão da doença na coluna vertebral ocorre de modo descendente com importante comprometimento cervical.
C a presença de entesites ativas se associa a um quadro de evolução mais lenta, com melhor qualidade de vida.
D a uveíte associada a espondilite anquilosante costuma ser anterior, aguda, bilateral e, por vezes, granulomatosa.
E a manifestação renal mais comum da EA é a glomerulonefrite membranosa, que pode cursar com hipertensão arterial e proteinúria persistente.