A é administrada por um Presidente e quatro Diretores, nomeados pelo Presidente da República, depois de aprovados pelo Senado Federal.
B conta com um colegiado composto pelos superintendentes e coordenado pelo Superintendente Geral.
C o Superintendente Geral acompanha e coordena as atividades desenvolvidas pelos membros do Colegiado.
D cabe à Superintendência Geral definir todas as políticas e estabelecer as práticas a serem implantadas e desenvolvidas.
E conta com a Superintendência de Fiscalização Bancária, que dá suporte direto ao Colegiado.