O objetivo do preparo químico-mecânico é limpar, ampliar e dar forma definida ao canal radicular para que ele possa receber o material obturador. O sucesso da terapia endodôntica depende do método e da eficiência desse preparo, da desinfecção e da obturação tridimensional do canal. Algumas técnicas laboratoriais têm sido utilizadas para a avaliação da eficiência do preparo químicomecânico, no que diz respeito à limpeza do canal radicular. Entre essas técnicas, destacam-se a microscopia óptica, corantes, substâncias radiopacas e a microscopia eletrônica de varredura. 

Observações realizadas com microscopia eletrônica de varredura, após o preparo químico-mecânico do canal radicular, têm revelado a presença de diminutos restos dentinários e uma substância amorfa aderida às suas paredes superficialmente, formando um aglomerado pastoso, que se deposita, principalmente, na região apical. Este aglomerado configura a(o/s)