A metodologia qualitativa, devendo ser considerados os agentes epidemiologicamente mais frequentes, tendo em vista o perfil epidemiológico da região, do próprio serviço e dos trabalhadores do serviço de saúde.
B metodologia quantitativa, devendo ser considerados os agentes epidemiologicamente mais importantes, de acordo com as notificações compulsórias da região.
C metodologia exploratória, devendo ser levantados todos os agentes etiológicos que causam adoecimento por doenças infecciosas no município e nas regiões circunvizinhas.
D metodologia descritiva, devendo ser caracterizados todos agentes infecciosos causadores de doenças infecciosas, tendo em vista o perfil epidemiológico da região, do próprio serviço e dos trabalhadores do serviço de saúde.