A Altos valores de razão sinal/ruído e ausência de picos correspondentes a proteínas de alta abundância.
B Aumento do erro de valores m/z para picos de referência e ausência de massa centroide.
C Baixa intensidade de picos correspondentes a proteínas de alta abundância e picos com baixa definição (largos ou mal resolvidos).
D Estreitamento da base do pico de referência e aumento da intensidade de picos monoisotópicos.
E Aparecimento de picos com alta intensidade nas faixas do espectro de alta razão massa-carga e presença de massa centroide.