Água potável deve estar em conformidade com o padrão de substâncias químicas e cianotoxinas que representam risco à saúde, devendo ser monitorada quanto à concentração dessas substâncias através de coleta de amostras e aferição de parâmetros relacionados à alteração desses compostos, assim como à dosagem dos compostos em si. Uma estratégia recomendada para monitoramento de cianobactérias em pontos de captação do manancial é a:
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