Sabe-se, atualmente, que existem dois genes envolvidos na determinação da cor dos olhos, denominados genes GEY e BEY. O gene GEY tem dois alelos, um dominante (GV), que condiciona a cor verde, e outro recessivo (GA), que condiciona a cor azul. Igualmente, o gene BEY tem dois alelos, um dominante (BM) que condiciona olhos castanhos, e outro recessivo, que condiciona a cor azul (BA). Sabe-se, também, que o gene BAY (BM), que condiciona olhos castanhos é epistático dominante sobre o gene GEY (GV e GA).
Assim, uma pessoa com olhos verdes e outra pessoa com olhos azuis apresentam, respectivamente, os seguintes genótipos
